MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 63174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020557	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020557	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020557	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020557	G	7	7	306	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020557	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	470205642
6	NC_020557	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	470205642
7	NC_020557	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205642
8	NC_020557	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205642
9	NC_020557	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205642
10	NC_020557	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205642
11	NC_020557	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205642
12	NC_020557	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470205642
13	NC_020557	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205642
14	NC_020557	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205642
15	NC_020557	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205642
16	NC_020557	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205642
17	NC_020557	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	470205642
18	NC_020557	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205642
19	NC_020557	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205642
20	NC_020557	AC	3	6	1015	1020	50 %	0 %	0 %	50 %	470205642
21	NC_020557	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205642
22	NC_020557	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205642
23	NC_020557	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	470205642
24	NC_020557	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470205642
25	NC_020557	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	470205642
26	NC_020557	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205642
27	NC_020557	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205642
28	NC_020557	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205642
29	NC_020557	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205642
30	NC_020557	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205642
31	NC_020557	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205642
32	NC_020557	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	470205642
33	NC_020557	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205642
34	NC_020557	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	470205642
35	NC_020557	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	470205642
36	NC_020557	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	470205642
37	NC_020557	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205642
38	NC_020557	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205642
39	NC_020557	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205642
40	NC_020557	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	470205642
41	NC_020557	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205642
42	NC_020557	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	470205642
43	NC_020557	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020557	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020557	T	6	6	1804	1809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020557	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020557	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020557	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205643
49	NC_020557	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205643
50	NC_020557	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205643
51	NC_020557	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205643
52	NC_020557	TCG	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205643
53	NC_020557	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205643
54	NC_020557	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	470205643
55	NC_020557	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470205643
56	NC_020557	A	6	6	2292	2297	100 %	0 %	0 %	0 %	470205643
57	NC_020557	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	470205643
58	NC_020557	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205643
59	NC_020557	ACA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205643
60	NC_020557	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	470205643
61	NC_020557	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205643
62	NC_020557	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	470205643
63	NC_020557	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205643
64	NC_020557	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205643
65	NC_020557	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205643
66	NC_020557	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470205643
67	NC_020557	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205643
68	NC_020557	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205643
69	NC_020557	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205643
70	NC_020557	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020557	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020557	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205644
73	NC_020557	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205644
74	NC_020557	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	470205644
75	NC_020557	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205644
76	NC_020557	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205644
77	NC_020557	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205644
78	NC_020557	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	470205644
79	NC_020557	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205644
80	NC_020557	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205644
81	NC_020557	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	470205644
82	NC_020557	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205644
83	NC_020557	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205644
84	NC_020557	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205644
85	NC_020557	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205644
86	NC_020557	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470205644
87	NC_020557	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	470205644
88	NC_020557	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	470205644
89	NC_020557	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205644
90	NC_020557	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205644
91	NC_020557	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205644
92	NC_020557	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205644
93	NC_020557	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205644
94	NC_020557	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470205644
95	NC_020557	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205644
96	NC_020557	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205644
97	NC_020557	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	470205644
98	NC_020557	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205644
99	NC_020557	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	470205644
100	NC_020557	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205644
101	NC_020557	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	470205644
102	NC_020557	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205644
103	NC_020557	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020557	T	7	7	4504	4510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020557	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020557	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_020557	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020557	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020557	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205645
110	NC_020557	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	470205645
111	NC_020557	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	470205645
112	NC_020557	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205645
113	NC_020557	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	470205646
114	NC_020557	TGCT	2	8	5002	5009	0 %	50 %	25 %	25 %	470205646
115	NC_020557	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205646
116	NC_020557	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205646
117	NC_020557	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	470205646
118	NC_020557	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205646
119	NC_020557	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	470205646
120	NC_020557	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205646
121	NC_020557	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205646
122	NC_020557	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	470205646
123	NC_020557	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	470205646
124	NC_020557	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205646
125	NC_020557	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205646
126	NC_020557	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205646
127	NC_020557	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205646
128	NC_020557	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205646
129	NC_020557	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205646
130	NC_020557	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205646
131	NC_020557	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205646
132	NC_020557	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	470205646
133	NC_020557	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020557	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020557	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020557	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205647
137	NC_020557	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205647
138	NC_020557	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205647
139	NC_020557	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470205647
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141	NC_020557	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205647
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143	NC_020557	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205647
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145	NC_020557	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205647
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147	NC_020557	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205647
148	NC_020557	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470205647
149	NC_020557	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205647
150	NC_020557	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	470205647
151	NC_020557	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470205647
152	NC_020557	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	470205647
153	NC_020557	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205647
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155	NC_020557	CAT	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205647
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159	NC_020557	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205647
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170	NC_020557	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205647
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172	NC_020557	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205647
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181	NC_020557	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_020557	A	6	6	10723	10728	100 %	0 %	0 %	0 %	470205649
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252	NC_020557	TTA	2	6	10849	10854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205649
253	NC_020557	ACT	2	6	10865	10870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205649
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256	NC_020557	ATTA	2	8	11021	11028	50 %	50 %	0 %	0 %	470205649
257	NC_020557	ACA	2	6	11050	11055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205649
258	NC_020557	CACATT	2	12	11199	11210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205649
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260	NC_020557	GAA	2	6	11477	11482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205649
261	NC_020557	AC	3	6	11518	11523	50 %	0 %	0 %	50 %	470205649
262	NC_020557	CGG	2	6	11543	11548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205649
263	NC_020557	TTGAT	2	10	11587	11596	20 %	60 %	20 %	0 %	470205649
264	NC_020557	GAG	2	6	11649	11654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470205649
265	NC_020557	GTG	2	6	11686	11691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205649
266	NC_020557	TTA	2	6	11704	11709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205649
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400	NC_020557	TGG	2	6	18311	18316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205656
401	NC_020557	CTT	2	6	18374	18379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
402	NC_020557	A	6	6	18481	18486	100 %	0 %	0 %	0 %	470205656
403	NC_020557	TTC	2	6	18498	18503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
404	NC_020557	GTT	2	6	18513	18518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205656
405	NC_020557	GTTT	2	8	18528	18535	0 %	75 %	25 %	0 %	470205656
406	NC_020557	CGT	2	6	18573	18578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205656
407	NC_020557	ACA	2	6	18676	18681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205656
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410	NC_020557	GAATG	2	10	18801	18810	40 %	20 %	40 %	0 %	470205656
411	NC_020557	GAT	2	6	18816	18821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205656
412	NC_020557	TGTC	2	8	18916	18923	0 %	50 %	25 %	25 %	470205656
413	NC_020557	TTC	3	9	18924	18932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
414	NC_020557	TCT	2	6	18952	18957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205656
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433	NC_020557	GTT	2	6	19815	19820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205658
434	NC_020557	ACA	2	6	19863	19868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205658
435	NC_020557	TTA	2	6	19882	19887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205658
436	NC_020557	TTCA	2	8	19902	19909	25 %	50 %	0 %	25 %	470205658
437	NC_020557	GCA	2	6	19989	19994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205658
438	NC_020557	A	6	6	20065	20070	100 %	0 %	0 %	0 %	470205658
439	NC_020557	T	7	7	20113	20119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_020557	TAATT	2	10	20179	20188	40 %	60 %	0 %	0 %	470205659
441	NC_020557	AAT	2	6	20234	20239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205659
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468	NC_020557	T	6	6	21305	21310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_020557	A	7	7	21367	21373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_020557	ATT	2	6	21379	21384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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